Nobita dan ayahnya membeli seekor kumbang badak besar, yang kemudian ia janjikan kepada ayahnya untuk merawatnya dengan baik. Kemudian, kelompok Doraemon menemukan sebuah pulau aneh tempat sebuah suku hidup berdampingan dengan makhluk prasejarah yang diyakini telah punah namun dilestarikan oleh roh kumbang mistis bernama Golden Hercules. Namun, kelompok tersebut harus berhadapan dengan sekelompok penjahat dari masa depan yang berniat menangkap Golden Hercules untuk mendapatkan keuntungan.