Doraemon dan teman-temannya membuka lubang waktu dan mereka melakukan perjalanan ke Negara Mayana, peradaban Maya yang hilang di hutan. Di sana, Nobita akan bertemu dengan kembarannya yang sempurna, Pangeran Thio, pewaris takhta. Keduanya akan memutuskan untuk bertukar dokumen untuk mencoba menyelamatkan Negara Mayana dari cengkeraman penyihir jahat Ledina dan pasukan jahatnya.