Dengan lima anak baru dan misi baru yang menarik di Dunia Digital, Digimon Frontier menghadirkan kembali semua aksi dan petualangan hebat selama tiga musim terakhir. Takuya, Kouji, Izumi, Junpei. dan Tomoki bertemu satu sama lain di kereta yang membawa mereka ke Dunia Digital tempat perang melawan kejahatan sedang terjadi. Digimon Malaikat, Cherubimon, salah satu dari tiga malaikat yang dikirim untuk menyelamatkan Dunia dari Lucemon yang haus kekuasaan, telah beralih ke sisi gelap dan seluruh Dunia Digital dalam bahaya. Untuk melawan pertempuran besar ini, kelima PILIHAN harus menemukan Densetsu no Spirit (Legendary Spirit).
