Takuya Arima adalah siswa muda yang ayahnya, seorang sejarawan yang telah melakukan berbagai penelitian, menghilang baru-baru ini. Selama liburan musim panas, Takuya menerima paket aneh dari ayahnya yang hilang, bersama dengan surat yang berisi informasi tentang keberadaan berbagai dunia paralel. Pada awalnya Takuya tidak menganggapnya serius, tetapi segera dia menyadari bahwa dia memiliki perangkat yang memungkinkannya melakukan perjalanan ke dimensi alternatif. Apakah ayahnya masih hidup? Jika demikian, di mana dia?