Kaito Kuroba, seorang murid SMA yang ayahnya sering absen karena alasan didefinisikan samar-samar. Ketika ayahnya meninggal secara misterius, ia dibuat sadar identitas rahasia ayahnya; penjahat internasional yang terkenal dikenal sebagai International Criminal 1412: Pencuri phantom, dan bahwa ia dibunuh oleh sebuah organisasi misterius karena menolak untuk membantu mereka dalam mengambil Pandora Gem batu mistis dikatakan meneteskan air mata selama berlalunya komet tertentu, konsumsi yang menganugerahkan keabadian. Dia bersumpah untuk mencegah organisasi dari mendapatkan keabadian, dan mengasumsikan identitas ayahnya saat ia mulai pencariannya untuk permata. Hanya petunjuk-Nya untuk lokasi permata ini adalah bahwa hal itu bersinar merah di bawah bulan purnama dan bahwa itu adalah doublet: permata tersembunyi dalam permata yang lebih besar. Dengan demikian, itu akan menjadi salah satu yang relatif besar dengan sejarah yang aneh, dan selalu disimpan di tempat