Di dunia Maburaho, setiap orang dilahirkan dengan kemampuan menggunakan sihir dan karenanya disebut penyihir. Namun, kemampuan sihir setiap orang tidaklah sama. Seberapa sering seseorang dapat menggunakan sihir menentukan seberapa besar rasa hormat yang diterimanya, dan karena kekuatan sihir seseorang ditentukan sejak lahir oleh sifat dan genetika, mereka yang memiliki garis keturunan penyihir terkenal sangat dicari. Memiliki jumlah sihir terendah di Akademi Aoi, Kazuki Shikimori dipandang rendah oleh teman-teman sekelasnya dan dianggap sebagai penyihir yang hampir tidak berguna. Namun, garis keturunannya terdiri dari banyak penyihir hebat sepanjang masa, yang berarti bahwa meskipun ia mungkin bukan penyihir hebat, keturunannya bisa menjadi penyihir hebat. Hal ini menyebabkan ia dicari oleh tiga wanita muda yang berbeda: Yuna Miyama, seorang siswa pindahan yang menyatakan dirinya sebagai istrinya saat tiba di sana, Rin Kamishiro, seorang pendekar pedang sombong dari keluarga tradisional yang ingin membunuhnya agar ia bebas mengejar keinginannya sendiri, dan Kuriko Kazetsubaki.