Di kota Heartland yang ramai dan futuristik, seorang anak laki-laki bernama Yuuma Tsukumo memiliki impian yang ingin dicapai semua orang seusianya—mendapatkan gelar duelist terhebat! Sayangnya, karena kemampuan duelnya yang kurang bagus, impian tersebut masih jauh dari tercapai. Tapi ketika pengganggu sekolah, Ryouga "Shark" Kamishiro, membagi kunci yang diberikan ayahnya menjadi dua bagian, dia secara tidak sengaja membuat Yuuma berada di jalur yang bertentangan dengan mimpinya.
